Le réseau d’assainissement des communes de l'agglomération est intégralement placé sous la responsabilité de l'ARC. Celle-ci a créé la quasi totalité des canalisations existantes hors de Compiègne, ainsi que toutes les stations d’épuration, dont celle très importante de La Croix Saint Ouen qui traite les eaux rejetées par Compiègne et sept autres communes (Jaux, Jonquières, Armancourt, La Croix Saint Ouen, Margny-lès-Compiègne, Le Meux et Venette).

Chaque année, l'ARC investit dans l’amélioration du réseau et des stations d’épuration. La dernière commune raccordée au réseau d’assainissement est Bienville (réseau mis en service en 2009).
 
En 2011, les travaux réalisés sur les stations d’épuration et les réseaux d’assainissement ont atteint un peu plus de 3,4 millions d’euros.